Gun들지마의 Bioinformatics 생명정보학

2016년 학계를 뜨겁게 달구었던 주제 중 하나는 지카바이러스가 아닐까 생각합니다.

지카 바이러스는 dengue, yellow fever, 일본뇌염, west nile virus 등과 마찬가지로 모기에 의해 전파되고 감염되는 바이러스의 한 종류 입니다. 그 이름은 바이러스가 처음 확인된 우간다의 지카숲에서 유래되었으며, 아프리카와 아시아를 거쳐서 남미에도 전파되어있습니다.

지카바이러스에 감염이 되면 대부분 미열을 동반한 감기 증상이 나타나는데, 일부의 경우 증상이 전혀 없을 수도 있어서 그 진단이 어렵습니다. 현재 활발한 연구가 되고 있지만, 아직까지는 이렇다할 치료제나 백신이 없는 상태이지만, 이 바이러스의 심각성은 감염자 자신보다는 감염자가 임신할 경우에 태아에게 소두증을 유발할 수가 있기 때문에 더욱더 위험합니다.

지카 바이러스에 관련하여 여러 재미있는 연구가 많이 진행되고 있지만, 바로 지난 달에 유전체 시퀀싱을 이용하여 지카 바이러스가 미국에 들어오게 된 경로 및 바이러스 유전체의 다양성을 파악하는 두 논문이 네이쳐에 실렸습니다.

첫번째 논문 (Faria et al., 2017) 은 MINION을 이용해서 주로 브라질의 환자에게서 얻은 샘플을 시퀀싱하여 지카 바이러스의 유전체를 조사 하였고, 두번째 논문 (Metsky et al., 2017)은 10개국의 환자와 모기에서 얻은 샘플을 일루미나 시퀀싱을 이용해서 유전체를 얻었습니다.

이렇게 얻은 유전체 데이터로 phylogenetic tree를 만들었고, 그 결과 과학자들은 브라질에서 캐러비안으로 전파된 바이러스가 플로리다를 통해 유입되었다는 결론을 유추해냈습니다.

사진출처: http://www.nature.com/nature/journal/v546/n7658/full/nature22495.html

그리고 이 연구로, 과학자들은 지카 바이러스가 플로리다에 적어도 4번의 독립적인 사건으로 전파 되었다고 결론내렸습니다.